Annika Schmidt absolvierte zunächst ein musikpädagogisches Studium an der Hochschule für Musik und Theater Hannover bei Prof. Jutta Rübenacker. Anschließend fügte sie an der Hochschule für Künste Bremen das Studium der künstlerischen Ausbildung im Fach Violine bei Prof. Thomas Klug (Konzertmeister der Deutschen Kammerphilharmonie Bremen) hinzu. Bereits während des Studiums spielte sie bei der Deutschen Kammerphilharmonie Bremen und der Jungen Deutschen Philharmonie. Zudem erhielt sie Unterricht im Fach Barockvioline bei Prof. Thomas Albert und nahm an Meisterkursen bei Howard Arman, Raimar Orlovsky (Berliner Barock Solisten) und Anne Schumann teil. Sie ist regelmäßig zu Gast bei den Händel-Festspielen Göttingen und den Musikwochen Weserbergland. Annika Schmidt ist Mitglied des ECHO-Klassik-prämierten Ensembles Handel's Company, des Ensembles Schirokko Hamburg und der Bremer Ratsmusik. Zudem ist sie Mitbegründerin des Astor-Klaviertrios.